崇祯元年（1628年），福建巡抚熊文灿招降郑芝龙，并授予游击将军衔。

从海盗的身份转变为了大明官员，这更是使得郑芝龙的实力急速壮大。

仅是短短数年时间过去，郑芝龙的麾下就有上千条船只，兵马数万之多。

而这个时候的郑芝龙，也因为平定海患有功，被朝廷提拔为了参将。

崇祯六年（1633年），荷兰侵略者入侵厦门，福建巡抚邹维琏派兵迎战。

在这场战役中，郑芝龙再次立下战功，从而又被提拔为了副总兵。

随后又在接下来数年时间内，郑芝龙接连击败了海盗巨寇刘香老等人，实力越发的得到了壮大，因此也被提拔为了福建总兵。

这个时候的郑芝龙，麾下已有战船上千，水师兵马数万，以及陆地兵马也有三万之多，实际权力已是大于福建巡抚。

为了能够彻底的掌控海贸市场，郑芝龙派出麾下水师冒充海盗，强行向过往商船收取高昂税金。

凡是没有缴纳税金者，皆是不能出海经商，一经发现便是船沉人亡，其手段可谓是极为残忍。

不过也正是凭借着强大的水师力量，郑芝龙很快纵横整个东南亚，就算大明朝廷水师也是无可奈何，只能是睁一只眼闭一只眼。

到了崇祯十七年（1644年）时，郑芝龙的实力已是达到了顶峰，并在安平镇开府建衙。

晋江城内的守城兵丁，也都全部是由郑芝龙发放军饷，听从郑芝龙的调令。

什么泉州知府，什么泉州参将，都得老老实实听从郑芝龙的命令。

此时在郑芝龙的麾下，大约有战船三千多艘，带甲之兵多达十万之众，压得东南亚小国无不瑟瑟发抖。